MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 22173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008269	CAA	2	6	436	441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024786
2	NC_008269	CG	3	6	480	485	0 %	0 %	50 %	50 %	111024786
3	NC_008269	CCG	2	6	487	492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024786
4	NC_008269	TCA	2	6	558	563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024786
5	NC_008269	CCCA	2	8	613	620	25 %	0 %	0 %	75 %	111024786
6	NC_008269	ACC	2	6	623	628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024786
7	NC_008269	CAC	2	6	633	638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024786
8	NC_008269	GCA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024786
9	NC_008269	CAG	2	6	661	666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024786
10	NC_008269	TCGC	2	8	676	683	0 %	25 %	25 %	50 %	111024786
11	NC_008269	GGGA	2	8	695	702	25 %	0 %	75 %	0 %	111024786
12	NC_008269	GA	3	6	719	724	50 %	0 %	50 %	0 %	111024786
13	NC_008269	GTC	2	6	749	754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024786
14	NC_008269	CGC	2	6	757	762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024786
15	NC_008269	GCC	2	6	767	772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024786
16	NC_008269	CACC	2	8	775	782	25 %	0 %	0 %	75 %	111024786
17	NC_008269	ACC	2	6	805	810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024786
18	NC_008269	CGA	2	6	827	832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024786
19	NC_008269	CCA	2	6	841	846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024786
20	NC_008269	CCAT	2	8	1129	1136	25 %	25 %	0 %	50 %	111024787
21	NC_008269	GGCC	2	8	1184	1191	0 %	0 %	50 %	50 %	111024787
22	NC_008269	CGT	2	6	1229	1234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024787
23	NC_008269	GCTC	2	8	1270	1277	0 %	25 %	25 %	50 %	111024787
24	NC_008269	ACC	2	6	1297	1302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024787
25	NC_008269	TCG	2	6	1349	1354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024787
26	NC_008269	GAT	2	6	1597	1602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024788
27	NC_008269	GTC	2	6	1619	1624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024788
28	NC_008269	TG	3	6	1632	1637	0 %	50 %	50 %	0 %	111024788
29	NC_008269	CGT	2	6	1647	1652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024788
30	NC_008269	GGT	2	6	1774	1779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024788
31	NC_008269	CTTCG	2	10	1791	1800	0 %	40 %	20 %	40 %	111024788
32	NC_008269	GGT	2	6	1870	1875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024788
33	NC_008269	AACC	2	8	1901	1908	50 %	0 %	0 %	50 %	111024788
34	NC_008269	GCC	2	6	1947	1952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024788
35	NC_008269	CGC	2	6	1957	1962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024788
36	NC_008269	TTC	2	6	1999	2004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024788
37	NC_008269	CCA	2	6	2007	2012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024788
38	NC_008269	CGAT	2	8	2094	2101	25 %	25 %	25 %	25 %	111024788
39	NC_008269	CG	3	6	2118	2123	0 %	0 %	50 %	50 %	111024788
40	NC_008269	CGT	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024788
41	NC_008269	GGGT	2	8	2203	2210	0 %	25 %	75 %	0 %	111024788
42	NC_008269	AGG	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024788
43	NC_008269	CACG	2	8	2243	2250	25 %	0 %	25 %	50 %	111024788
44	NC_008269	TCT	2	6	2283	2288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024788
45	NC_008269	ACC	2	6	2327	2332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024788
46	NC_008269	CAT	2	6	2419	2424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024789
47	NC_008269	TTC	2	6	2437	2442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024789
48	NC_008269	GCG	2	6	2525	2530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024789
49	NC_008269	CTTC	2	8	2571	2578	0 %	50 %	0 %	50 %	111024789
50	NC_008269	TG	3	6	2586	2591	0 %	50 %	50 %	0 %	111024789
51	NC_008269	GGT	2	6	2686	2691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024789
52	NC_008269	CAG	2	6	2710	2715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024789
53	NC_008269	CTA	2	6	3210	3215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024790
54	NC_008269	CCG	2	6	3229	3234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024790
55	NC_008269	CCCG	2	8	3251	3258	0 %	0 %	25 %	75 %	111024790
56	NC_008269	TCC	2	6	3313	3318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024790
57	NC_008269	TCA	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024790
58	NC_008269	CG	3	6	3383	3388	0 %	0 %	50 %	50 %	111024790
59	NC_008269	GA	3	6	3450	3455	50 %	0 %	50 %	0 %	111024790
60	NC_008269	CGACCA	2	12	3512	3523	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111024790
61	NC_008269	ACC	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024791
62	NC_008269	CGC	2	6	3670	3675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024791
63	NC_008269	CGG	2	6	3721	3726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024791
64	NC_008269	CCA	2	6	3733	3738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024791
65	NC_008269	CAC	2	6	3740	3745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024791
66	NC_008269	ACC	3	9	3762	3770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024791
67	NC_008269	ACG	2	6	3781	3786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024791
68	NC_008269	CAC	3	9	3851	3859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024791
69	NC_008269	GCT	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024791
70	NC_008269	CG	3	6	3891	3896	0 %	0 %	50 %	50 %	111024791
71	NC_008269	CAC	2	6	3925	3930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024791
72	NC_008269	TCC	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024791
73	NC_008269	TCC	2	6	3988	3993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024791
74	NC_008269	CGCA	2	8	4011	4018	25 %	0 %	25 %	50 %	111024791
75	NC_008269	CCT	2	6	4025	4030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024791
76	NC_008269	CGC	2	6	4033	4038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024791
77	NC_008269	GCA	2	6	4042	4047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024791
78	NC_008269	C	6	6	4087	4092	0 %	0 %	0 %	100 %	111024791
79	NC_008269	GTC	2	6	4141	4146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024791
80	NC_008269	AGTG	2	8	4195	4202	25 %	25 %	50 %	0 %	111024791
81	NC_008269	TGG	2	6	4203	4208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024791
82	NC_008269	CGC	2	6	4211	4216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024791
83	NC_008269	TGG	2	6	4283	4288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024792
84	NC_008269	AGGAG	2	10	4293	4302	40 %	0 %	60 %	0 %	111024792
85	NC_008269	GCTG	2	8	4313	4320	0 %	25 %	50 %	25 %	111024792
86	NC_008269	CCG	2	6	4448	4453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024792
87	NC_008269	CAC	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024792
88	NC_008269	GC	3	6	4482	4487	0 %	0 %	50 %	50 %	111024792
89	NC_008269	GGCG	2	8	4488	4495	0 %	0 %	75 %	25 %	111024792
90	NC_008269	ATC	2	6	4498	4503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024792
91	NC_008269	CGC	2	6	4536	4541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024792
92	NC_008269	CCG	2	6	4562	4567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024792
93	NC_008269	GAC	2	6	4576	4581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024792
94	NC_008269	GATCCG	2	12	4635	4646	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111024792
95	NC_008269	GAA	4	12	4669	4680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024792
96	NC_008269	GCG	2	6	4698	4703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024792
97	NC_008269	GC	3	6	4739	4744	0 %	0 %	50 %	50 %	111024792
98	NC_008269	CGA	2	6	4752	4757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024792
99	NC_008269	CGC	2	6	4818	4823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024792
100	NC_008269	GCC	2	6	4839	4844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024792
101	NC_008269	CGGC	2	8	4857	4864	0 %	0 %	50 %	50 %	111024792
102	NC_008269	GGA	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024793
103	NC_008269	AC	3	6	4890	4895	50 %	0 %	0 %	50 %	111024793
104	NC_008269	CGGC	2	8	4924	4931	0 %	0 %	50 %	50 %	111024793
105	NC_008269	CAC	2	6	4934	4939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024793
106	NC_008269	GCT	2	6	5003	5008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
107	NC_008269	CTG	2	6	5022	5027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
108	NC_008269	ACG	2	6	5035	5040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024793
109	NC_008269	TGC	2	6	5050	5055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
110	NC_008269	CGG	2	6	5111	5116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024793
111	NC_008269	CGC	3	9	5129	5137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
112	NC_008269	CGG	2	6	5140	5145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024793
113	NC_008269	TCG	2	6	5155	5160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
114	NC_008269	GCG	2	6	5200	5205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024793
115	NC_008269	GCT	2	6	5327	5332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
116	NC_008269	CTG	2	6	5367	5372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
117	NC_008269	TGA	2	6	5380	5385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024793
118	NC_008269	TCGCGG	2	12	5392	5403	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111024793
119	NC_008269	GTG	2	6	5424	5429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024793
120	NC_008269	CCG	2	6	5515	5520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
121	NC_008269	CGG	2	6	5536	5541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024793
122	NC_008269	GGGGT	2	10	5553	5562	0 %	20 %	80 %	0 %	111024793
123	NC_008269	GCC	3	9	5580	5588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
124	NC_008269	GCTCG	2	10	5591	5600	0 %	20 %	40 %	40 %	111024793
125	NC_008269	GCG	2	6	5613	5618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024793
126	NC_008269	GCC	2	6	5640	5645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
127	NC_008269	GTG	2	6	5646	5651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024793
128	NC_008269	GCCG	2	8	5661	5668	0 %	0 %	50 %	50 %	111024793
129	NC_008269	TGC	2	6	5719	5724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
130	NC_008269	CCG	3	9	5728	5736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
131	NC_008269	TGC	2	6	5780	5785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024793
132	NC_008269	CGG	2	6	5944	5949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024793
133	NC_008269	CTCA	2	8	5954	5961	25 %	25 %	0 %	50 %	111024793
134	NC_008269	CCG	2	6	5962	5967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
135	NC_008269	CCG	2	6	5998	6003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024793
136	NC_008269	CAA	2	6	6010	6015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024793
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261	NC_008269	GGTG	2	8	11935	11942	0 %	25 %	75 %	0 %	111024799
262	NC_008269	GCGCG	2	10	11957	11966	0 %	0 %	60 %	40 %	111024799
263	NC_008269	CGA	2	6	11994	11999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024799
264	NC_008269	CGT	2	6	12148	12153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024799
265	NC_008269	CGC	3	9	12190	12198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024799
266	NC_008269	GCA	2	6	12206	12211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024799
267	NC_008269	CGC	2	6	12217	12222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024799
268	NC_008269	GGT	2	6	12223	12228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024799
269	NC_008269	CCG	2	6	12288	12293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024799
270	NC_008269	CCG	2	6	12308	12313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024799
271	NC_008269	ACG	3	9	12320	12328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024799
272	NC_008269	CTC	2	6	12412	12417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024799
273	NC_008269	CGCC	2	8	12437	12444	0 %	0 %	25 %	75 %	111024799
274	NC_008269	CCGA	2	8	12466	12473	25 %	0 %	25 %	50 %	111024799
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278	NC_008269	CCGGG	2	10	12679	12688	0 %	0 %	60 %	40 %	111024799
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280	NC_008269	GCG	4	12	12758	12769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024799
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283	NC_008269	CCG	2	6	12840	12845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024799
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286	NC_008269	GGC	2	6	13035	13040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024800
287	NC_008269	CGG	2	6	13071	13076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024800
288	NC_008269	CAG	2	6	13123	13128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024800
289	NC_008269	CGA	2	6	13149	13154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024800
290	NC_008269	CGA	2	6	13182	13187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024800
291	NC_008269	CGT	2	6	13200	13205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024800
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294	NC_008269	GCC	2	6	13228	13233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024800
295	NC_008269	CGA	2	6	13242	13247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024800
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298	NC_008269	CGC	2	6	13348	13353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024800
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343	NC_008269	TCGG	2	8	16159	16166	0 %	25 %	50 %	25 %	111024803
344	NC_008269	GTCC	2	8	16177	16184	0 %	25 %	25 %	50 %	111024803
345	NC_008269	CG	3	6	16210	16215	0 %	0 %	50 %	50 %	111024803
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380	NC_008269	ACA	2	6	17588	17593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024804
381	NC_008269	GCC	2	6	17600	17605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024804
382	NC_008269	TCG	2	6	17630	17635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024804
383	NC_008269	CGA	2	6	17667	17672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024804
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386	NC_008269	CGA	2	6	17877	17882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024804
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388	NC_008269	CCTG	2	8	17939	17946	0 %	25 %	25 %	50 %	111024804
389	NC_008269	CAG	2	6	17950	17955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024804
390	NC_008269	ACG	2	6	18005	18010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024804
391	NC_008269	ACCG	2	8	18094	18101	25 %	0 %	25 %	50 %	111024804
392	NC_008269	ACG	2	6	18113	18118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024804
393	NC_008269	CTC	3	9	18145	18153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024804
394	NC_008269	GCT	2	6	18156	18161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024804
395	NC_008269	GC	4	8	18221	18228	0 %	0 %	50 %	50 %	111024804
396	NC_008269	CGGCG	2	10	18321	18330	0 %	0 %	60 %	40 %	111024804
397	NC_008269	GTC	2	6	18361	18366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024804
398	NC_008269	CGCC	2	8	18370	18377	0 %	0 %	25 %	75 %	111024804
399	NC_008269	ACG	2	6	18425	18430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024804
400	NC_008269	CGC	2	6	18472	18477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024804
401	NC_008269	CTC	2	6	18536	18541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024804
402	NC_008269	CGT	2	6	19091	19096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024805
403	NC_008269	GGT	2	6	19098	19103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024805
404	NC_008269	GGC	2	6	19152	19157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024805
405	NC_008269	GTG	2	6	19269	19274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024805
406	NC_008269	GCGCGA	2	12	19289	19300	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111024805
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410	NC_008269	CAG	2	6	19492	19497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024805
411	NC_008269	CTTC	2	8	19535	19542	0 %	50 %	0 %	50 %	111024805
412	NC_008269	CACG	2	8	19574	19581	25 %	0 %	25 %	50 %	111024805
413	NC_008269	GAG	2	6	19587	19592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024805
414	NC_008269	CAC	2	6	19617	19622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024805
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416	NC_008269	CTT	2	6	19719	19724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024806
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418	NC_008269	ACC	2	6	19831	19836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024806
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420	NC_008269	GCT	2	6	19930	19935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024806
421	NC_008269	CCA	2	6	19987	19992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024806
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423	NC_008269	CCA	2	6	20047	20052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024806
424	NC_008269	CCGA	2	8	20055	20062	25 %	0 %	25 %	50 %	111024806
425	NC_008269	ATC	2	6	20097	20102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024806
426	NC_008269	CTT	2	6	20177	20182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024806
427	NC_008269	ACA	2	6	20196	20201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024806
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454	NC_008269	GC	3	6	21578	21583	0 %	0 %	50 %	50 %	111024808
455	NC_008269	CAA	2	6	21591	21596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024808
456	NC_008269	CCA	2	6	21599	21604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024808
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458	NC_008269	TGG	2	6	21748	21753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024808
459	NC_008269	CCG	2	6	21775	21780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024808
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461	NC_008269	CGA	2	6	22059	22064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024809
462	NC_008269	TGC	2	6	22091	22096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024809
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466	NC_008269	CGGT	2	8	22184	22191	0 %	25 %	50 %	25 %	111024809
467	NC_008269	CCGACG	2	12	22246	22257	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111024809
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492	NC_008269	CATCCG	2	12	23274	23285	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111024810
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496	NC_008269	CAG	2	6	23394	23399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024811
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498	NC_008269	GCC	3	9	23489	23497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024811
499	NC_008269	GAT	2	6	23525	23530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024811
500	NC_008269	CCT	2	6	23591	23596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024811

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